Klinik für Anästhesie und Kinderanästhesie (Klinik St. Hedwig)
Klinik für Anästhesie und operative Intensivmedizin
Klinik für Augenheilkunde
Klinik und Poliklinik für Frauenheilkunde und Geburtshilfe - Lehrstuhl für Gynäkologie und Geburtshilfe - Schwerpunkt Geburtshilfe der Universität Regensburg (Klinik St. Hedwig)
Klinik für Gefäßchirurgie
Klinik für Geriatrische Rehabilitation
Klinik für Hals-Nasen-Ohrenheilkunde
Klinik für Herzrhythmusstörungen
Klinik für Innere Medizin I: Endokrinologie, Angiologie, Nephrologie
Klinik für Innere Medizin II: Gastroenterologie, Hepatologie, Infektiologie, Rheumatologie
Klinik für Kardiologie
Klinik und Poliklinik für Kinder- und Jugendmedizin - Lehrstuhl für Kinderheilkunde und Jugendmedizin der Universität Regensburg (Klinik St. Hedwig)
Klinik für Kinderchirurgie (Klinik St. Hedwig)
Klinik für Kinderurologie am Lehrstuhl für Urologie der Universität Regensburg (Klinik St. Hedwig)
Klinik für Mund-, Kiefer- und Plastische Gesichtschirurgie
Klinik für Neurochirurgie
Klinik für Neurologie
Klinik für Nuklearmedizin
Klinik für Onkologie und Hämatologie
Klinik für Palliativmedizin
Klinik für Plastische, Hand- und wiederherstellende Chirurgie
Klinik für Pneumologie (wird seit 01.01.2011 als eigenständige Klinik geführt)
Klinik für Strahlentherapie
Klinik für Thoraxchirurgie
Klinik für Unfallchirurgie und Orthopädie, Sportmedizin
Klinik für Urologie
Institut für Radiologie und Neuroradiologie
Notfallzentrum
Belegabteilung für Hals-Nasen-Ohrenheilkunde im Kindes- und Jugendalter (Klinik St. Hedwig)